Сергей Ботнараш выступал на позиции вратаря за тираспольский «Тилигул», бельцкую «Зарю», одесский СКА (Украина) и кишинёвский «Зимбру». Он был первым вратарём в истории молдавского футбола после обретения независимости, забившим гол в высшей лиге. Произошло это в сезоне 1996/1997, в матче «Чугур» (Окница) – «Зимбру» (1:15). Ботнараш в той встрече играл нападающим (!!!), а не голкипером!
Он был трёхкратным чемпионом с «Зимбру» в качестве игрока, затем завоевал ещё три титула как тренер вратарей. Был главным тренером в кишинёвской «Политехнике», столичной «Дачии», комратской «Гагаузии» и ФК «Костулень».
Позже Ботнараш работал вторым тренером в молодёжной сборной Молдовы (U-21) и в национальной сборной, за которую провёл один матч в начале 90-х.